要知道伯大尼為一修院，前身更是一所供海外傳教士休養的療養院，自然就有教會在背後支援，到底這座百年的法定古蹟最初是出於何種原因而被建立，「巴黎外方傳教會」又是何方神聖呢?
顧名思義，「巴黎外方傳教會」當然是總部設於巴黎的教會，是一個1664年獲得教宗的批准而成立的法國天主教男性使徒生活團，全稱Missions étrangères de Paris, M.E.P.，主力從事海外傳教的工作，故名外方傳教。在歷史上，不少亞洲地區的傳教工作都與這個教會有關，17世紀的中國兩廣，甚至西南、西藏都有這個教會的蹤跡，而其他的東南亞地區就有越南、柬埔寨和泰國等。
巴黎外方傳教會本以澳門為總部，但隨住《北京條約》的簽訂，就決定在地理上更接近中國的香港，設立他們的辦事處。後來因為大規模的海外傳教活動，不少的神職人員來自歐洲，難以適應東南亞一帶的氣候而罹患熱帶疾病。有見及此，法國外方傳道會就允許奧塞神父於1873年6月買地，並且自行設計修院，興建了第一所東亞地區療養院，為傳教士提供休養的地方。建造修院所用的花崗岩石材，更是由當年的港英政府捐贈。
按照官方的統計，營運接近百年，這所療養院就已經接待了6000多名傳教士，當中有接近100名的傳教士不敵痛魔離世，下葬於伯大尼修院的墓地。除了疾病，伯大尼修院亦都是遠東地區傳教士的避難所，而主要的時期就在上世紀的冷戰期間。先不論少數被驅逐出境的傳教士，就在政權更替而發生的禁教時期，伯大尼修院就發揮了其作用，收容了這些傳教士，單是冷戰期間就有70多人，真是一所見證時代變遷的建築。
