屬一級歷史建築的基督君王小堂被圍繞在學校、醫院當中，至今都仍然保留著建成早年的外貌，在瞬息萬變的香港甚為難得。
基督君皇小聖堂的正立面向東北聖保祿醫院，正門前是巨大的圓柱，正門及兩面側門上有三角楣飾。值得一提，正立面頂的三角楣飾內有一個圓形大鐘，此鐘現時已經停止運作，時間永遠滯留於12時26分。大鐘上方乃一座白色手托地球的基督君王像，下方額枋則刻有拉丁文REGEM REGUM VENITE ADOREMUS，意思是讓我們朝拜皇中之皇。
建築師以早期基督徒的羅馬式建築風格，又稱古典復興風格來設計聖堂，平面呈十字形，以格林多柱支撐著圓形頂蓋，而大部分為圓柱，只有四角位的是方柱。格林多柱比愛奧尼柱更為纖細，柱身筆直連著底座，特色是柱頂雕花，有更強的裝飾性。柱頂雕有茛苕作裝飾，像一棵巍然屹立的大樹散發茂盛的葉一樣，象徵著生命。順帶一提，英國倫敦特拉法加廣場中的納爾遜紀念柱就是格林多柱。
聖堂右邊入口處有螺旋形樓梯，可直達能包廂，可容納二百人，這就是我們常稱的經樓。經樓面積頗大，俯視可觀看整個聖堂，包廂的管形風琴現在已損壞，不可再用，因此成為古董。
內部結構以古典風格佈置，地上鋪着充滿色彩的馬賽克地磚，亦有華麗的天使雕刻，顯得亮麗典雅。教堂內樓底空間特別高，斜屋頂則鋪上中式瓦片，見中西混合建築風格。此外，聖堂全部柱樑都建在外面，沒有柱樑阻礙內部視線，這也是聖堂特色之一。因此建築內部寬闊，明窗淨几，空氣亦流通，可以清楚看見祭台。
原先祭台與聖體櫃相連，由環形領聖體欄杆圍繞著，位於拱形凹處的半圓形的台上，放在聖堂另一邊。而祭台後方高牆上有六個玻璃窗，左右兩旁的牆上凹槽中放有聖若瑟像和聖保祿像。經過1973年的重新修葺後，祭台被移致正中間。主祭台用意大利雲石製造，台下刻著最後晚餐像浮雕，是一位法國藝術家設計的，由修女好友捐贈從而成為現今使用的祭台。那祭台後方的六扇玻璃窗門改為彩色玻璃窗裝飾，中間是耶穌基督，寓意祂是我們生活中心。一邊是聖母領報，象徵聖母首肯展開救贖人類工程。 另一邊是聖母蒙召升天，象徵人類最完美的救贖是效法聖母，承行天父旨意，跟隨基督。這為祭台背景增一分莊重的氛圍。
