青山禪院，又名青山寺，位於屯門青山東麓，歷史可追溯至一千五百年前的東晉末年，因而被稱為千年古剎（ 年代久遠的寺廟）。
相傳劉宋年間，杯渡禪師喜歡坐著一隻大木杯雲遊四海。有一次他結伴共遊屯門青山，他暫住的地方就是最初的「普渡寺」。後人為紀念杯渡禪師曾到訪該地，逐於該處建成一座小廟，名為「杯渡庵」，該山亦叫作「杯渡山」。其後寺廟曾多次重建及易名，於隋代更被改為道觀，名為「普渡道場」，至唐代才變回佛寺並改稱「雲林寺」。寺廟旁邊還有一座一千年前的「杯渡」大石像，據說是由杯渡禪師的徒弟所建。後來宋徽宗於宣和元年將寺廟再次改為道觀，名為「斗姆宮」，元代改稱「青道觀」。
清初寺廟一度因沿海內遷而荒廢。1842年（道光二十二年），當地士紳重修該觀，後來該地歸屯門陶氏產業。至1914年陳春亭被委任為主持後，1918年陳春亭前往寧波觀宗寺，受三壇大戒，法號顯奇，後回到青山加建寺廟、寶殿等建築，並重修青雲觀，慢慢發展成今日的「青山禪院」。
青山禪院是香港十分罕有的廟宇建築群，最初整座建築群被列為一級歷史建築，後來分別改成五座維持為一級歷史建築、五座列為二級歷史建築，及一座列為三級歷史建築。