聖瑪加利大堂屬於「古典復興主義」（Neoclassical architecture）建築，所謂古典復興即是重新將古希臘以及古羅馬的美學帶進建築設計裡。這種建築風格從十八世紀中開始盛行。隨著當時人們對考古的重視，不少新古典主義者強調建築與古希臘和古羅馬的關聯。然而，與文藝復興時期不同的是，人們對古代事物和歷史有更深認識，所以古希臘和古羅馬建築又被視為理性的象徵。
教堂的正前方是一條長樓梯，頓時為整座建築增添氣勢。沿著樓梯拾級而上，你會看見大門兩旁放置了聖保多祿和聖保祿的兩尊聖像。門廊由四根立克柱所支撐，雖然教堂佔地面積不算大，但長樓梯和門外的柱子令建築變得更莊嚴宏偉。
教堂內部採用法國十八世紀結合古典和歌德式的柱列承托拱形天花的結構。呈圓拱型的天花佈滿浮雕方格，與大部分教堂相似，兩側設有大量彩色玻璃窗。而且，牆壁上有一共14幅耶穌受難至復活整個過程的木刻雕像。教堂盡頭的聖所呈半圓形，旁邊有一旋轉石梯，直達鐘樓。
